L'objectif général de la mention est la formation de chercheurs et de professionnels pour un exercice en France ou à l'étranger, dans le champs des systèmes de santé: épidémiologie et évaluation des problèmes de santé, conception gestion et évaluation des programmes de santé; connaissance de l'économie et des sciences sociales dans leurs applications en santé publique.
L'obtention du grade de Master Santé publique permet d'une part d'accéder à une formation doctorale (spécialité R), d'autre part de postuler dans différents établissements de santé ou organismes de santé publique (spécialité P).
Pour la spécialité "Problèmes de santé et développement des systèmes de santé dans les pays tropicaux, une demande d'équivalence avec l'European Master of sciences in International Health Programs est en cours.
Ce Master de Santé Publique est axé sur l'annalyse des systèmes de santé, qui constitue l'objectif principal de la spécialité recherche, et des méthodologies qui y sont enseignées. Cette approche donne aussi un cadre conceptuel général à la déclinaison des différentes spécialités professionnelles.
Un principe général du Master, qui s'applique à toutes les spécialités consiste, en M1, à homogénéiser les connaissances des étudiants issus des filières santé et de ceux issus de filières de sciences économiques. Ces derniers suivent les UE obligatoires de matières médicales (anatomie, physiologie, bactériologie, grandes pathologies) tandis que les premiers ont des UE obligatoires en méthodes quantitatives, micro et macro économie, techniques de gestion. En termes de matières transversales, quelle que soit la spécialité, l'étudiant acquiert des connaissances globales sur le concept de système de santé, et sur l'approche nécesairement multidisciplinaire qu'il requiert. Un effort important est également fait pour l'acquisition de connaissances transversales: recherche bibliographique et lecture critique d'articles, conduite de projets, communication, utilisation de l'outil informatique. Par ailleurs, les étudiants qui n'ont pas un niveau suffisant au TOEFL suivent l'UE d'Anglais.
Pour l'ensemble des spécialités du Master, et de manière plus ou moins approfondie selon qu'il s'agit de la spécialité recherche ou des spécialités professionnelles, l'étudiant acquiert une compétence globale à se repérer dans le système de santé et à comprendre les intéractions complexes d'un problème spécifique avec l'ensemble de l'édifice.
L'étudiant doit aussi être capable d'utiliser des outils d'analyse, issus de disciplines différentes mais complémentaires, qui sont aussi bien quantitatifs (statistique, économétrie, épidémiologie, évaluation médico économoique) que qualitatifs (entretiens, audits, évaluation des pratiques...) et d'y recourir dans le domaine de sa spécialité.
